MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 8600

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009525	GACG	2	8	303450	303457	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
502	NC_009525	CGG	2	6	303493	303498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_009525	CGGCC	2	10	303505	303514	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
504	NC_009525	CA	3	6	304138	304143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
505	NC_009525	GGA	2	6	306796	306801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_009525	AGG	2	6	306805	306810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_009525	GGC	2	6	307729	307734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_009525	CAG	2	6	310826	310831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_009525	GCT	2	6	310850	310855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_009525	AGC	2	6	310857	310862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_009525	CGG	2	6	310910	310915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_009525	CCG	2	6	310920	310925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_009525	GTC	2	6	310934	310939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_009525	AGC	2	6	310948	310953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_009525	CAG	2	6	310966	310971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_009525	GTG	3	9	310973	310981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_009525	CGG	2	6	311459	311464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_009525	TCGG	2	8	311487	311494	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
519	NC_009525	GCG	2	6	311500	311505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_009525	GTC	2	6	311527	311532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_009525	CGG	2	6	311562	311567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_009525	CCA	2	6	311591	311596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_009525	CA	3	6	311620	311625	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
524	NC_009525	TGC	2	6	314068	314073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_009525	TTG	2	6	315577	315582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_009525	GGC	2	6	315649	315654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_009525	AGCGG	2	10	315660	315669	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
528	NC_009525	GCT	2	6	317130	317135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_009525	TCC	2	6	317136	317141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_009525	TCGGC	2	10	317823	317832	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
531	NC_009525	CG	4	8	318879	318886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
532	NC_009525	GC	3	6	322604	322609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
533	NC_009525	CGG	3	9	324091	324099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_009525	ATA	2	6	324668	324673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_009525	CG	3	6	327617	327622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
536	NC_009525	AAC	2	6	329874	329879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_009525	TTA	2	6	329891	329896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_009525	AGATTC	2	12	331725	331736	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
539	NC_009525	GCC	2	6	331750	331755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_009525	ATC	2	6	333025	333030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_009525	AGT	2	6	334745	334750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_009525	GGT	2	6	334768	334773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_009525	ATG	2	6	334778	334783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_009525	AAG	2	6	337745	337750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_009525	ACA	2	6	337767	337772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_009525	G	6	6	337776	337781	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
547	NC_009525	GT	3	6	337828	337833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_009525	GCCG	2	8	337873	337880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
549	NC_009525	TGGC	2	8	337885	337892	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
550	NC_009525	CGG	2	6	340501	340506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_009525	GCA	2	6	340600	340605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_009525	GCG	2	6	340656	340661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_009525	GTG	2	6	340666	340671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_009525	TCA	2	6	340698	340703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_009525	GTG	2	6	340711	340716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_009525	GGTCGC	2	12	343423	343434	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_009525	CGC	2	6	351322	351327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_009525	GA	3	6	352877	352882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_009525	CTG	2	6	353188	353193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_009525	GAT	2	6	362602	362607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_009525	GCG	2	6	364575	364580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_009525	TAG	2	6	364598	364603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_009525	ATC	2	6	365177	365182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_009525	G	7	7	365861	365867	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
565	NC_009525	CTGT	2	8	365879	365886	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
566	NC_009525	AATC	2	8	377120	377127	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
567	NC_009525	CTA	2	6	377130	377135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_009525	TCG	2	6	377246	377251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_009525	CTTGA	2	10	379252	379261	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
570	NC_009525	CGT	2	6	379996	380001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_009525	ACC	2	6	381809	381814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_009525	CGC	2	6	381865	381870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_009525	GTA	2	6	383820	383825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_009525	GAG	2	6	383841	383846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_009525	CGG	2	6	384924	384929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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577	NC_009525	TCA	2	6	387326	387331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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579	NC_009525	GCA	2	6	387378	387383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_009525	TCGCA	2	10	387422	387431	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
581	NC_009525	CGA	2	6	387465	387470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_009525	GGCC	2	8	387480	387487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
583	NC_009525	GCC	2	6	387512	387517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_009525	AAGG	2	8	388496	388503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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587	NC_009525	TTC	2	6	389218	389223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_009525	GCG	2	6	389921	389926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_009525	TCG	2	6	389937	389942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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591	NC_009525	GGA	2	6	392627	392632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_009525	GC	3	6	392638	392643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
593	NC_009525	GCC	2	6	392653	392658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_009525	GGC	2	6	395408	395413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_009525	GAC	2	6	396686	396691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_009525	ATA	2	6	397456	397461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_009525	TGAC	2	8	397465	397472	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
598	NC_009525	GTCA	2	8	397476	397483	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
599	NC_009525	GCG	2	6	397506	397511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_009525	AT	3	6	397530	397535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_009525	CGG	2	6	400890	400895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_009525	CGG	2	6	401432	401437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_009525	GTA	2	6	401516	401521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_009525	TTG	2	6	403099	403104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_009525	GTT	2	6	403112	403117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_009525	GCG	2	6	403153	403158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_009525	CGC	3	9	403168	403176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_009525	CGC	2	6	407278	407283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_009525	CGG	3	9	409818	409826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_009525	CGG	2	6	409906	409911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_009525	AGG	2	6	409984	409989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_009525	CGG	2	6	410583	410588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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615	NC_009525	TGG	2	6	415639	415644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
616	NC_009525	CAACG	2	10	415648	415657	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
617	NC_009525	CG	3	6	416344	416349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
618	NC_009525	GCG	2	6	416825	416830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_009525	TGG	2	6	418342	418347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_009525	CTT	2	6	418348	418353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_009525	CG	3	6	418358	418363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
622	NC_009525	ATCG	2	8	418446	418453	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
623	NC_009525	TGT	2	6	418467	418472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_009525	GCCA	2	8	418537	418544	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
625	NC_009525	GTCC	2	8	418563	418570	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
626	NC_009525	ACGG	2	8	418649	418656	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
627	NC_009525	CCG	2	6	421118	421123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_009525	TCA	2	6	421150	421155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_009525	AAG	2	6	421166	421171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_009525	AGG	2	6	421184	421189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_009525	GC	3	6	425386	425391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
632	NC_009525	GAGC	2	8	425431	425438	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
633	NC_009525	GC	3	6	425437	425442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_009525	GAGC	2	8	425482	425489	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
635	NC_009525	GC	3	6	425488	425493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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637	NC_009525	GTG	2	6	436079	436084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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